Huberarchaea

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METABOLISM           
 Carbohydrate metabolism           
   Pentose phosphate pathway 1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1) - 
   Galactose metabolism  -  1+0=1(u:0) -   -   -   -   -   -   -   -   - 
   Starch and sucrose metabolism 1+0=1(u:1)2+0=2(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1) - 
   Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1+0=1(u:1)4+1=5(u:2)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)2+0=2(u:2)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1) - 
   Pyruvate metabolism 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
 Energy metabolism           
   Oxidative phosphorylation 1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1) - 
   Sulfur metabolism  -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:0) -  1+0=1(u:0) -   - 
 Lipid metabolism           
   Glycerolipid metabolism  -   -   -   -   -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:1)
   Glycerophospholipid metabolism 1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)2+0=2(u:1)
 Nucleotide metabolism           
   Purine metabolism 10+1=11(u:0)12+1=13(u:0)12+1=13(u:0)12+1=13(u:0)11+1=12(u:0)12+1=13(u:0)12+1=13(u:0)12+1=13(u:0)12+2=14(u:0)12+1=13(u:0)4+1=5(u:0)
   Pyrimidine metabolism 15+1=16(u:3)17+1=18(u:3)17+1=18(u:3)17+1=18(u:3)16+1=17(u:3)15+1=16(u:2)17+1=18(u:3)17+1=18(u:3)15+2=17(u:2)17+1=18(u:3)5+1=6(u:0)
 Amino acid metabolism           
   Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0) - 
   Glycine, serine and threonine metabolism  -   -   -   -   -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:0)
   Cysteine and methionine metabolism 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)2+0=2(u:1) - 
   Arginine and proline metabolism 2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1) - 
   Tyrosine metabolism 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   Phenylalanine metabolism 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis 2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0) - 
 Metabolism of other amino acids           
   Selenocompound metabolism 2+0=2(u:0)2+1=3(u:0)2+0=2(u:0)2+1=3(u:0)2+1=3(u:0)2+0=2(u:0)2+1=3(u:0)2+0=2(u:0)2+1=3(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)
 Glycan biosynthesis and metabolism           
   N-Glycan biosynthesis 3+0=3(u:2)3+0=3(u:2)3+0=3(u:2)3+1=4(u:2)3+0=3(u:2)3+1=4(u:2)2+1=3(u:2)3+0=3(u:2)3+0=3(u:2)3+0=3(u:2)1+0=1(u:1)
   Various types of N-glycan biosynthesis 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -  1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
 Metabolism of cofactors and vitamins           
   One carbon pool by folate 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -  1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -  1+0=1(u:0) - 
   Thiamine metabolism 1+0=1(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)1+0=1(u:0) -  2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   Riboflavin metabolism  -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:0) -  1+0=1(u:0) -   - 
   Porphyrin and chlorophyll metabolism 1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+1=2(u:0)1+0=1(u:0)
 Metabolism of terpenoids and polyketides           
   Polyketide sugar unit biosynthesis  -  6+0=6(u:2) -  1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -  5+0=5(u:1)4+0=4(u:0)1+0=1(u:0) -   - 
   Terpenoid backbone biosynthesis 2+0=2(u:2)2+0=2(u:2)2+0=2(u:2)2+0=2(u:2)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)2+0=2(u:2)2+0=2(u:2)1+0=1(u:1)2+0=2(u:2) - 
   Biosynthesis of vancomycin group antibiotics  -  1+0=1(u:0) -   -   -   -  1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -   -   - 
 Biosynthesis of other secondary metabolites           
   Penicillin and cephalosporin biosynthesis  -  1+0=1(u:1) -   -   -   -   -   -   -   -   - 
   Novobiocin biosynthesis 2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0) - 
   Streptomycin biosynthesis  -  4+0=4(u:0) -  1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -  4+0=4(u:0)4+0=4(u:0)1+0=1(u:0) -   - 
   Isoquinoline alkaloid biosynthesis 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
 
GENETIC INFORMATION PROCESSING           
 Transcription           
   RNA polymerase 6+1=7(u:0)7+1=8(u:0)7+1=8(u:0)7+1=8(u:0)6+1=7(u:0)7+1=8(u:0)7+1=8(u:0)7+1=8(u:0)7+2=9(u:0)7+1=8(u:0)2+1=3(u:0)
   Basal transcription factors 3+0=3(u:2)3+1=4(u:2)3+0=3(u:2)3+0=3(u:2)2+0=2(u:1)3+0=3(u:2)3+1=4(u:2)3+0=3(u:2)3+0=3(u:2)3+1=4(u:2) - 
   Spliceosome 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
 Translation           
   Aminoacyl-tRNA biosynthesis 23+0=23(u:21)23+0=23(u:21)23+0=23(u:21)23+0=23(u:21)22+0=22(u:20)20+0=20(u:18)23+0=23(u:21)23+0=23(u:21)23+0=23(u:21)23+0=23(u:21)10+0=10(u:8)
   Ribosome biogenesis in eukaryotes 8+0=8(u:4)8+0=8(u:4)8+0=8(u:4)8+0=8(u:4)6+0=6(u:2)7+0=7(u:3)7+0=7(u:4)8+0=8(u:4)8+0=8(u:4)8+0=8(u:4)4+0=4(u:2)
   Ribosome 33+12=45(u:32)36+11=47(u:35)33+10=43(u:32)35+11=46(u:34)34+10=44(u:33)32+10=42(u:31)36+11=47(u:35)33+11=44(u:32)36+11=47(u:35)34+11=45(u:33)11+3=14(u:11)
   RNA transport 9+0=9(u:6)10+0=10(u:7)10+0=10(u:7)9+0=9(u:6)9+0=9(u:6)9+0=9(u:6)9+0=9(u:7)10+0=10(u:7)10+0=10(u:7)10+0=10(u:7)3+0=3(u:1)
   mRNA surveillance pathway 3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)2+0=2(u:2)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)1+0=1(u:1)
 Folding, sorting and degradation           
   RNA degradation 3+0=3(u:3)4+0=4(u:4)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)4+0=4(u:4)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)3+0=3(u:3)1+0=1(u:1)
   Proteasome 2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)2+1=3(u:2)1+1=2(u:1)1+0=1(u:1)
   Protein export 5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)5+2=7(u:1)1+0=1(u:0)
   Ubiquitin mediated proteolysis  -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:0) -   -   -   - 
   Sulfur relay system 1+0=1(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)1+0=1(u:0) -  2+0=2(u:0)2+0=2(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   Protein processing in endoplasmic reticulum 5+1=6(u:3)4+1=5(u:2)4+1=5(u:2)4+1=5(u:2)4+1=5(u:2)4+1=5(u:2)4+2=6(u:3)4+1=5(u:2)4+1=5(u:2)4+0=4(u:2)3+0=3(u:2)
 Replication and repair           
   DNA replication 11+0=11(u:5)13+0=13(u:6)12+0=12(u:5)12+0=12(u:5)12+0=12(u:5)12+0=12(u:5)13+0=13(u:6)12+0=12(u:5)12+0=12(u:5)10+1=11(u:4)6+0=6(u:3)
   Base excision repair 5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)4+0=4(u:1)5+0=5(u:2)5+0=5(u:2)2+0=2(u:0)
   Nucleotide excision repair 5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)5+0=5(u:0)4+0=4(u:0)2+0=2(u:0)
   Mismatch repair 5+0=5(u:1)5+0=5(u:1)5+0=5(u:1)5+0=5(u:1)5+0=5(u:1)5+0=5(u:1)4+0=4(u:0)4+0=4(u:0)5+0=5(u:1)4+0=4(u:1)2+0=2(u:0)
   Homologous recombination 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) -   - 
   Non-homologous end-joining 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   Fanconi anemia pathway 2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)
 
ENVIRONMENTAL INFORMATION PROCESSING           
 Membrane transport           
   Bacterial secretion system 4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)4+2=6(u:1)1+0=1(u:1)
 Signal transduction           
   Two-component system 2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1)2+0=2(u:1) - 
   HIF-1 signaling pathway 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   mTOR signaling pathway 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   PI3K-Akt signaling pathway 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0) - 
   AMPK signaling pathway 1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1) - 
 
CELLULAR PROCESSES           
 Transport and catabolism           
   Phagosome 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)
 Cell growth and death           
   Cell cycle 1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)2+0=2(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)1+0=1(u:0)
   Cell cycle - yeast  -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:0) -   -   -   - 
   Cell cycle - Caulobacter 1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+1=2(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)2+0=2(u:2)
   Meiosis - yeast 1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)2+0=2(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1)1+0=1(u:1) - 
   Oocyte meiosis  -   -   -   -   -   -  1+0=1(u:0) -   -   -   -