#Table S4 piRNA clusters: chr, start, end, strand #mapped to RGSC3.4 chr10 36512951 36521590 - chr10 48508049 48508667 - chr10 59659822 59666691 - chr10 92610558 92617280 - chr10 94574932 94583881 - chr10 97742436 97748755 - chr10 15550114 15554172 + chr10 15706197 15717543 + chr10 59967283 59974921 + chr10 84467735 84475770 + chr10 90641081 90647976 + chr10 92616057 92640295 + chr10 94557122 94563558 + chr10 94581144 94582790 + chr10 95451439 95454886 + chr11 82895639 82912866 - chr11 84931788 84973669 - chr11 85518313 85520202 - chr11 82907609 82913789 + chr11 84961493 84973847 + chr11 84985948 84991835 + chr12 11120287 11124729 - chr12 11129298 11129774 - chr12 27559223 27564399 - chr12 43044162 43049193 - chr12 44254521 44276965 - chr12 44279848 44321866 - chr12 5595818 5636897 + chr12 11103823 11108945 + chr12 11110596 11112637 + chr12 20775767 20775864 + chr12 20779276 20779496 + chr12 20787520 20793532 + chr12 27573639 27576343 + chr12 43044126 43077994 + chr12 44204899 44209394 + chr12 44271939 44274746 + chr12 44281590 44328556 + chr13 45889931 45895474 - chr13 71877429 71880541 - chr13 73584798 73597034 - chr13 73605393 73627274 - chr13 73628760 73642633 - chr13 37640451 37645459 + chr13 73628774 73647641 + chr14 3286458 3288414 - chr14 20909797 20913214 - chr14 42001702 42007852 - chr14 86160680 86161585 - chr14 103209273 103211074 - chr15 184144 259915 - chr15 44174298 44181516 - chr15 249610 261881 + chr15 84141882 84148430 + chr16 48553750 48555904 - chr16 71299798 71304340 + chr17 17490759 17494484 - chr17 17498023 17500476 - chr17 17501924 17507456 - chr17 17518458 17552248 - chr17 17554671 17556365 - chr17 18976897 18983580 - chr17 18999584 19000530 - chr17 20164855 20168164 - chr17 20354613 20362376 - chr17 20426756 20428255 - chr17 20450952 20458355 - chr17 20483369 20490723 - chr17 20793031 20802507 - chr17 47220129 47221971 - chr17 62932516 62933473 - chr17 12615527 12620232 + chr17 17498024 17498839 + chr17 17502131 17507253 + chr17 20185133 20198099 + chr17 20748641 20749848 + chr17 20758785 20772647 + chr17 20774422 20792079 + chr18 25032440 25036549 - chr18 63546163 63584880 - chr18 63570969 63588427 + chr18 71511096 71520783 + chr19 11529919 11533295 - chr19 15899277 15932538 - chr19 39605868 39612814 - chr19 55060216 55066332 - chr19 15927430 15945720 + chr19 39996475 39998305 + chr19 40004355 40013719 + chr19 41059235 41063195 + chr19 47313107 47321369 + chr1 13900499 13919865 - chr1 13921059 13928307 - chr1 13929331 13936881 - chr1 13941989 13958259 - chr1 15601422 15605518 - chr1 48277504 48279390 - chr1 48335658 48338758 - chr1 48345156 48347633 - chr1 48363616 48366678 - chr1 48369383 48378863 - chr1 49002753 49007244 - chr1 49020615 49045730 - chr1 49069366 49071829 - chr1 50779069 50783598 - chr1 50835119 50839237 - chr1 92601040 92604251 - chr1 92605546 92612435 - chr1 92628373 92628471 - chr1 92697170 92697355 - chr1 102010615 102018286 - chr1 102919754 102929153 - chr1 102938343 102939069 - chr1 124809243 124850157 - chr1 128250564 128267690 - chr1 128987071 129040044 - chr1 184345431 184356303 - chr1 184391663 184392496 - chr1 187302933 187303228 - chr1 192180379 192184137 - chr1 208476819 208480017 - chr1 241523635 241529867 - chr1 241533871 241534198 - chr1 22090286 22092739 + chr1 47726146 47730684 + chr1 47742375 47743778 + chr1 47745210 47745817 + chr1 47836633 47839806 + chr1 47847561 47866197 + chr1 47965507 47969605 + chr1 47970964 47974101 + chr1 47984262 47987115 + chr1 51022112 51036656 + chr1 65590574 65606120 + chr1 102750187 102750897 + chr1 102758850 102769397 + chr1 124833922 124875908 + chr1 128256016 128300780 + chr1 128302095 128304479 + chr1 128310612 128318849 + chr1 128999766 129024426 + chr1 129025490 129040485 + chr1 129042459 129058966 + chr1 129065200 129073769 + chr1 129082578 129088677 + chr1 179034348 179037204 + chr1 184398965 184403631 + chr1 227069708 227073713 + chr20 2085641 2091740 - chr20 3041416 3042797 - chr20 5478714 5565377 - chr20 13179735 13218551 - chr20 13219707 13222343 - chr20 29558271 29561015 - chr20 4259749 4275795 + chr20 5498701 5588531 + chr20 13190805 13223039 + chr20 17933870 17946752 + chr20 21878860 21881273 + chr20 22747249 22752388 + chr20 29897795 29918830 + chr20 29920722 29942311 + chr20 29946328 29959084 + chr2 44390030 44413114 - chr2 105652182 105654182 - chr2 105656139 105657743 - chr2 105659808 105659961 - chr2 105661273 105662588 - chr2 105665464 105668469 - chr2 105675411 105678136 - chr2 105685306 105685848 - chr2 105711401 105724725 - chr2 105726101 105732079 - chr2 105733415 105746670 - chr2 105748591 105771626 - chr2 105772744 105782616 - chr2 191038483 191043600 - chr2 221194541 221195957 - chr2 221200167 221200337 - chr2 221203434 221204853 - chr2 221205898 221206669 - chr2 221215396 221216153 - chr2 221221439 221221599 - chr2 121160235 121162499 + chr2 121194893 121202631 + chr2 123868918 123875020 + chr2 191062814 191068222 + chr2 204557741 204562356 + chr3 556409 556997 - chr3 17325523 17334940 - chr3 18528818 18532590 - chr3 76919394 76941519 - chr3 76955462 76970004 - chr3 133018232 133021251 - chr3 140473695 140488110 - chr3 140672306 140673754 - chr3 140674782 140686784 - chr3 141058036 141065354 - chr3 141066421 141087858 - chr3 141684739 141691085 - chr3 141692340 141692946 - chr3 76928640 76979619 + chr3 76989223 77005069 + chr3 115211047 115214348 + chr3 115216056 115216400 + chr3 115224644 115225848 + chr3 115226925 115236188 + chr3 137425445 137426971 + chr3 140146332 140155258 + chr3 140161276 140169687 + chr3 141752275 141764768 + chr4 2227589 2230674 - chr4 116139200 116146288 - chr4 116147344 116148133 - chr4 116151218 116151519 - chr4 119282384 119287063 - chr4 119293791 119294875 - chr4 119333569 119338043 - chr4 119342052 119342767 - chr4 119356030 119356686 - chr4 120123446 120131742 - chr4 120133057 120139634 - chr4 122156194 122183741 - chr4 122184763 122186545 - chr4 122187918 122198057 - chr4 122597940 122599227 - chr4 135102641 135105192 - chr4 152578760 152578913 - chr4 164218865 164284511 - chr4 164680888 164686862 - chr4 164764925 164771713 - chr4 164894740 164898613 - chr4 165223893 165225588 - chr4 4833186 4835646 + chr4 119314655 119317107 + chr4 119769248 119772183 + chr4 122179647 122183386 + chr4 122188241 122202679 + chr4 126344991 126348796 + chr4 149619159 149625608 + chr4 149627587 149631840 + chr4 157289884 157294981 + chr4 161313509 161315946 + chr4 164236598 164303795 + chr4 164704753 164710182 + chr4 164771148 164771571 + chr4 164791739 164798053 + chr4 164815074 164817943 + chr4 165456648 165458398 + chr4 165459717 165468033 + chr4 184112320 184112563 + chr5 25403616 25431124 - chr5 58056103 58059588 - chr5 63093302 63094936 - chr5 63115717 63118152 - chr5 75285626 75292587 - chr5 75294817 75298304 - chr5 79193308 79197752 - chr5 79240391 79242693 - chr5 114515889 114536175 - chr5 114537396 114568459 - chr5 129337096 129342777 - chr5 143145334 143153357 - chr5 143181019 143187735 - chr5 150678954 150693235 - chr5 166246286 166249530 - chr5 167074109 167079396 - chr5 2318032 2319233 + chr5 25424477 25429123 + chr5 25620246 25637353 + chr5 79241997 79242686 + chr5 79244109 79252484 + chr5 114563633 114568309 + chr5 121703115 121704706 + chr5 154397688 154403602 + chr5 172454001 172457286 + chr6 93594917 93601396 - chr6 93603919 93612010 - chr6 122354876 122355669 - chr6 122535553 122588782 - chr6 26481608 26484817 + chr6 93605428 93614357 + chr6 106295902 106297267 + chr6 122578008 122617332 + chr6 122618347 122623098 + chr6 122625549 122628696 + chr7 16141568 16153399 - chr7 17356966 17361595 - chr7 17803433 17808365 - chr7 18781145 18786706 - chr7 18788276 18789811 - chr7 18797015 18800322 - chr7 18801582 18807092 - chr7 19364518 19366646 - chr7 20500884 20509010 - chr7 22459054 22464915 - chr7 22475504 22481976 - chr7 31856289 31865612 - chr7 91159578 91162798 - chr7 94677507 94710734 - chr7 96010584 96021726 - chr7 96022944 96060643 - chr7 99315188 99315320 - chr7 110818551 110826976 - chr7 112727381 112741808 - chr7 112742834 112751660 - chr7 115440818 115458133 - chr7 116583659 116631286 - chr7 122564801 122570414 - chr7 142101047 142107782 - chr7 11365197 11368859 + chr7 18834552 18845015 + chr7 19449275 19450568 + chr7 94705681 94718730 + chr7 96048465 96072311 + chr7 96076655 96089528 + chr7 112736366 112765391 + chr7 113562302 113572997 + chr7 115449187 115476424 + chr7 116627653 116658959 + chr7 121555093 121556992 + chr7 121565342 121569986 + chr8 38526046 38534662 - chr8 47128264 47135849 - chr8 57705692 57752523 - chr8 72043744 72094089 - chr8 103116620 103137438 - chr8 127472904 127487828 - chr8 127494667 127504338 - chr8 57746846 57758951 + chr8 72066568 72085382 + chr8 72087362 72099101 + chr8 72102523 72110324 + chr8 72113052 72118362 + chr8 72121211 72126233 + chr8 80236988 80247582 + chr8 93871069 93874537 + chr8 114914555 114920766 + chr9 5956567 5963052 - chr9 42251825 42253558 - chr9 90630780 90634342 - chr9 92260476 92270750 - chr9 92272618 92274692 - chr9 104920198 104936518 - chr9 104939934 104945714 - chr9 105029841 105032675 - chr9 105063057 105069839 - chr9 105138400 105139619 - chr9 105237329 105246366 - chr9 105308374 105325582 - chr9 7093947 7096352 + chr9 19677992 19681545 + chr9 74839095 74842801 + chr9 90774227 90779905 + chr9 104922400 104936502 + chr9 104943018 104950568 + chr9 104980615 104984847 + chr9 105067392 105096543 + chr9 105103924 105107881 + chr9 105173507 105178626 + chr9 105242602 105243447 + chr9 105245581 105246379 + chr9 105247631 105252413 + chr9 105315377 105338339 + chr9 105339816 105345850 +