The following describes the information in each column of AdditionalFile1.txt 1 window number 2 chromosome 3 window mid-point 4 number of 30SNP haplotypes, dairy 5 HapH Holstein (Hol) 6 HapH Jersey (Jer) 7 number of 30SNP haplotypes, beef 8 HapH Angus (AA) 9 HapH Charolais (CC) 10 HapH Hereford (HH) 11 HapH Limousin (LL) 12 HapH Murray Grey (MG) 13 HapH Shorthorn (SS) 14 number of snps for fst 15 fst Jer_Hol 16 fst AA_Hol 17 fst AA_Jer 18 fst CC_Hol 19 fst CC_Jer 20 fst CC_AA 21 fst HH_Hol 22 fst HH_Jer 23 fst HH_AA 24 fst HH_CC 25 fst LL_Hol 26 fst LL_Jer 27 fst LL_AA 28 fst LL_CC 29 fst LL_HH 30 fst MG_Hol 31 fst MG_Jer 32 fst MG_AA 33 fst MG_CC 34 fst MG_HH 35 fst MG_LL 36 fst SS_Hol 37 fst SS_Jer 38 fst SS_AA 39 fst SS_CC 40 fst SS_HH 41 fst SS_LL 42 fst SS_MG 43 fst dairy_vs_beef 44 iHS number Snp, dairy 45 iHS Hol 46 iHS Jer 47 iHS number Snp, beef 48 iHS AA 49 iHS CC 50 iHS HH 51 iHS LL 52 iHS MG 53 iHS SS 54 number of genes 55 gene Ensbtag 56 gene Name