CG	Dmel.chr	Dmel.geneSTART	Dmel.geneSTOP	Dmel.geneORIENT	Dpse.chr	Dpse.geneSTART	Dpse.geneSTOP	Dpse.geneORIENT	inv.num	Dmel.invSTARTREL	Dmel.invSTOPREL	Dmel.invSTART.genome	Dmel.invSTOP.genome	Dmel.exon.overlap	Dmel.gene.overlap	Dmel.invLEN	Dpse.invSTARTREL	Dpse.invSTOPREL	Dpse.invLEN	num.Dmel.introns	Dmel.invINTRON	Dmel.invINTRON.size	Dmel.invINTRON.sizerank	Dmel.invINTRON.leftdist	Dmel.invINTRON.rightdist
CG3653	X	2956234	2988959	+	XL_group1e	2477073	2515603	+	1	10441	10846	2966674	2967079	0	NA	406	7855	8190	336	6	1	28320	6	10199	17715
CG3653	X	2956234	2988959	+	XL_group1e	2477073	2515603	+	2	18871	19786	2975104	2976019	0	NA	916	20141	21276	1136	6	1	28320	6	18629	8775
CG3653	X	2956234	2988959	+	XL_group1e	2477073	2515603	+	3	22951	23191	2979184	2979424	0	NA	241	24482	24694	213	6	1	28320	6	22709	5370
CG3653	X	2956234	2988959	+	XL_group1e	2477073	2515603	+	4	23956	24046	2980189	2980279	0	NA	91	25500	25584	85	6	1	28320	6	23714	4515
CG3936	X	2991028	3028418	+	XL_group1e	2514546	2559816	+	1	8761	8836	2999788	2999863	0	NA	76	10445	10546	102	8	1	12147	8	7804	4267
CG3936	X	2991028	3028418	+	XL_group1e	2514546	2559816	+	2	10621	10996	3001648	3002023	0	NA	376	12754	13140	387	8	1	12147	8	9664	2107
CG3936	X	2991028	3028418	+	XL_group1e	2514546	2559816	+	3	13831	13996	3004858	3005023	0	NA	166	16062	16238	177	8	2	7861	7	636	7059
CG3936	X	2991028	3028418	+	XL_group1e	2514546	2559816	+	4	25831	26431	3016858	3017458	0	NA	601	30982	31433	452	8	5	4245	6	1468	2176
CG2872	X	3430694	3510945	+	XL_group1e	8615870	8712258	-	1	37741	37906	3468434	3468599	0	NA	166	35832	36020	189	10	1	46654	10	37357	9131
CG2872	X	3430694	3510945	+	XL_group1e	8615870	8712258	-	2	55771	55936	3486464	3486629	0	NA	166	61421	61620	200	10	2	13248	9	8684	4398
CG2872	X	3430694	3510945	+	XL_group1e	8615870	8712258	-	3	64876	67636	3495569	3498329	0	NA	2761	72690	75504	2815	10	3	9818	8	4082	2975
CG3665	X	3979609	4051327	-	XL_group3a	2374055	2465558	+	1	21256	21301	4030026	4030071	0	NA	46	30294	30333	40	10	2	48434	10	18355	30033
CG3665	X	3979609	4051327	-	XL_group3a	2374055	2465558	+	2	27331	28111	4023216	4023996	0	NA	781	37676	38289	614	10	2	48434	10	24430	23223
CG3665	X	3979609	4051327	-	XL_group3a	2374055	2465558	+	3	36046	36301	4015026	4015281	0	NA	256	45112	45303	192	10	2	48434	10	33145	15033
CG3578	X	4258093	4329701	+	XL_group1a	3579226	3668438	-	1	42841	43306	4300933	4301398	0	NA	466	53246	53751	506	7	4	27108	7	4656	21986
CG6824	X	4893534	4914941	+	XL_group1e	6689509	6715709	+	1	7111	7186	4900644	4900719	0	NA	76	8314	8392	79	6	1	14301	6	5864	8361
CG16752	X	5291898	5338794	+	XL_group1a	8511479	8567937	-	1	10351	10396	5302248	5302293	0	NA	46	17026	17067	42	5	1	14720	4	10035	4639
CG2302	X	8128193	8174914	-	XL_group1e	1885797	1943007	+	1	17956	18046	8156868	8156958	0	NA	91	22210	22296	87	9	1	22048	9	17625	4332
CG2302	X	8128193	8174914	-	XL_group1e	1885797	1943007	+	2	20701	21841	8153073	8154213	0	NA	1141	25173	26364	1192	9	1	22048	9	20370	537
CG12154	X	8476576	8495886	-	XL_group1e	7746296	7767666	-	1	14956	16426	8479460	8480930	0	NA	1471	16502	18244	1743	3	3	6397	2	4664	262
CG11354	X	8602471	8651011	-	XL_group1e	7885828	7942435	-	1	31291	32101	8618910	8619720	0	NA	811	35954	36642	689	6	3	18667	6	13124	4732
CG11354	X	8602471	8651011	-	XL_group1e	7885828	7942435	-	2	44581	44941	8606070	8606430	0	NA	361	48842	49265	424	6	5	9099	4	6860	1878
CG12650	X	9256913	9264208	+	XL_group1a	7591151	7599115	-	1	6991	7051	9263903	9263963	0	NA	61	7039	7095	57	4	4	278	1	185	32
CG32666	X	11338388	11400264	+	XL_group1e	1689783	1760694	+	1	33211	33556	11371598	11371943	0	NA	346	45683	46131	449	6	2	56477	6	32380	23751
CG32613	X	13784259	13801268	-	XL_group1e	6346099	6370164	+	1	751	931	13800337	13800517	0	NA	181	2406	2620	215	1	1	14043	1	688	13174
CG32600	X	14156163	14296308	+	XL_group1e	4894895	5042632	-	1	117421	118636	14273583	14274798	0	NA	1216	116692	117708	1017	9	6	18960	7	14289	3455
CG32600	X	14156163	14296308	+	XL_group1e	4894895	5042632	-	2	126391	128341	14282553	14284503	0	NA	1951	121582	124032	2451	9	7	8441	4	4088	2402
CG9533	X	14623188	14659842	-	XL_group1e	4534096	4577632	+	1	11821	11866	14647976	14648021	0	NA	46	4634	4679	46	17	2	23366	17	10703	12617
CG9623	X	16586126	16617371	-	XL_group1a	6566604	6605524	+	1	15526	16306	16601065	16601845	0	NA	781	19618	20174	557	11	4	5241	10	1943	2517
CG6352	X	17624987	17647925	+	XL_group1e	12053577	12080589	+	1	571	916	17625557	17625902	0	NA	346	2498	2914	417	3	1	20232	3	171	19715
CG15455	X	20351557	20364559	+	XL_group1e	8999218	9016340	+	1	4231	8236	20355787	20359792	0	NA	4006	6843	10522	3680	2	2	11525	2	3066	4453
CG1379	X	20409219	20416158	-	XL_group1e	9065058	9074727	-	1	3391	4021	20412137	20412767	0	NA	631	4284	5029	746	3	3	5337	3	2005	2701
CG2762	2L	523467	540541	+	4_group3	1041502	1068564	-	1	5176	5551	528642	529017	0	NA	376	9632	10107	476	7	2	10586	7	3205	7005
CG14351	2L	1555159	1607617	+	4_group3	10088217	10159538	+	1	20071	20941	1575229	1576099	0	NA	871	29092	29758	667	10	2	43700	10	18313	24516
CG8817	2L	2885952	2953077	+	4_group4	4201826	4309448	-	1	22126	22171	2908077	2908122	0	NA	46	36556	36597	42	13	3	39067	13	17160	21861
CG8817	2L	2885952	2953077	+	4_group4	4201826	4309448	-	2	27961	28261	2913912	2914212	0	NA	301	47413	47818	406	13	3	39067	13	22995	15771
CG8817	2L	2885952	2953077	+	4_group4	4201826	4309448	-	3	34651	35161	2920602	2921112	0	NA	511	59411	59978	568	13	3	39067	13	29685	8871
CG3327	2L	3334871	3355000	-	4_group3	6195656	6231701	+	1	4081	4366	3350634	3350919	0	NA	286	8848	9508	661	8	2	14028	8	1555	12187
CG31774	2L	3905513	3947160	-	4_group3	2056684	2125337	+	1	4666	5371	3941789	3942494	0	NA	706	10503	11809	1307	8	2	16460	8	4000	11754
CG12676	2L	4031379	4115059	+	4_group3	1802645	1915900	-	1	29266	29866	4060644	4061244	0	NA	601	32858	33456	599	8	2	41744	8	27874	13269
CG14026	2L	5218996	5271353	-	4_group3	6942881	7011165	-	1	46306	46546	5224807	5225047	0	NA	241	58003	58296	294	6	5	14685	5	11287	3157
CG7235	2L	5662849	5670842	+	4_group4	3143093	3151550	-	1	5266	5671	5668114	5668519	0	NA	406	5701	6088	388	2	1	5767	2	5132	229
CG9019	2L	5925937	5938767	+	4_group1	360197	378098	-	1	7246	8236	5933182	5934172	0	NA	991	11346	12520	1175	4	3	7768	4	4810	1967
CG33531	2L	6272817	6322251	+	4_group5	2010364	2136655	-	1	13861	14146	6286677	6286962	0	NA	286	27142	27462	321	15	2	10647	14	7892	2469
CG33531	2L	6272817	6322251	+	4_group5	2010364	2136655	-	2	31681	32131	6304497	6304947	0	NA	451	61848	62331	484	15	13	16377	15	646	15280
CG33531	2L	6272817	6322251	+	4_group5	2010364	2136655	-	3	32506	32911	6305322	6305727	0	NA	406	65972	66363	392	15	13	16377	15	1471	14500
CG11326	2L	6686819	6709085	-	4_group1	3798030	3829901	-	1	10396	10861	6698224	6698689	0	NA	466	15209	15523	315	14	7	2307	12	1074	767
CG31629	2L	7100093	7133683	-	4_group2	718702	762614	-	1	11326	11416	7122267	7122357	0	NA	91	16941	17042	102	5	1	13468	5	10033	3344
CG13784	2L	7205250	7220029	-	4_group3	881098	898309	+	1	6211	6841	7213188	7213818	0	NA	631	7615	8505	891	6	2	8989	6	4823	3535
CG33529	2L	7497805	7544423	-	4_group3	1344562	1409678	-	1	32806	34036	7510387	7511617	0	NA	1231	44626	45809	1184	5	3	27676	5	17583	8862
CG8049	2L	8259504	8301072	-	4_group3	3845319	3906426	+	1	33136	33436	8267636	8267936	0	NA	301	45160	45466	307	14	7	9255	13	3998	4956
CG13109	2L	9166802	9246386	+	4_group5	1369917	1466433	+	1	25501	25921	9192302	9192722	0	NA	421	32407	32824	418	12	2	42174	12	488	41265
CG6464	2L	11434311	11445603	-	4_group3	6832445	6844406	-	1	1261	1351	11444252	11444342	0	NA	91	1586	1671	86	3	1	4776	3	684	4001
CG31757	2L	11830126	11928570	-	4_group3	9088560	9200653	-	1	59071	59671	11868899	11869499	0	NA	601	63243	63990	748	6	3	72912	6	42185	30126
CG31762	2L	12205843	12312801	+	4_group3	5772215	5923456	-	1	55381	56191	12261223	12262033	0	NA	811	71176	72946	1771	15	2	29155	14	19442	8902
CG31762	2L	12205843	12312801	+	4_group3	5772215	5923456	-	2	64516	64576	12270358	12270418	0	NA	61	84797	84852	56	15	2	29155	14	28577	517
CG12287	2L	12657829	12686313	+	4_group3	3387700	3425267	+	1	17281	17971	12675109	12675799	0	NA	691	22394	23116	723	5	3	4958	4	1461	2806
CG7147	2L	13550141	13638263	+	4_group1	1853923	2009188	-	1	26716	27601	13576856	13577741	0	NA	886	65514	67042	1529	12	3	50958	12	18023	32049
CG31811	2L	13835567	13898715	+	4_group4	5819839	5892881	-	1	31576	31966	13867142	13867532	0	NA	391	33694	34190	497	9	1	42532	9	30709	11432
CG4220	2L	14387122	14409547	-	4_group1	3526930	3564453	+	1	5296	6001	14403546	14404251	0	NA	706	9853	10719	867	7	2	13045	7	3342	8997
CG4838	2L	15996466	16036976	+	4_group4	4847167	4901553	+	1	37366	37726	16033831	16034191	0	NA	361	49219	49617	399	7	7	1348	3	375	612
CG31784	2L	17098361	17121804	-	4_group3	11332699	11360538	+	1	10951	11476	17110328	17110853	0	NA	526	13034	13704	671	8	5	4376	6	3400	450
CG12621	2L	17154491	17166044	+	4_group4	49366	65104	+	1	6466	7351	17160956	17161841	0	NA	886	8288	9028	741	2	2	7817	2	3030	3901
CG15138	2L	17185739	17256661	-	4_group4	78488	161392	-	1	27721	29356	17227305	17228940	0	NA	1636	27741	28882	1142	5	2	54422	5	18496	34290
CG15138	2L	17185739	17256661	-	4_group4	78488	161392	-	2	32446	32761	17223900	17224215	0	NA	316	33544	34956	1413	5	2	54422	5	23221	30885
CG15138	2L	17185739	17256661	-	4_group4	78488	161392	-	3	36151	37216	17219445	17220510	0	NA	1066	38331	40092	1762	5	2	54422	5	26926	26430
CG18397	2L	18912454	18939877	-	4_group3	2266651	2303177	-	1	20026	22756	18917121	18919851	0	NA	2731	25753	28893	3141	10	6	15808	10	12501	576
CG10443	2L	19607339	19727491	+	4_group5	1596045	1722634	+	1	2686	3391	19610024	19610729	0	NA	706	4974	5716	743	16	1	32641	15	2468	29467
CG1864	2L	20671053	20702182	-	4_group3	7520265	7557198	+	1	14776	16441	20685741	20687406	0	NA	1666	19388	21100	1713	4	1	22580	4	13222	7692
CG31612	2L	21749882	21783038	-	4_group1	1130259	1166725	-	1	16921	17386	21765652	21766117	0	NA	466	17610	18086	477	3	1	19947	3	16868	2613
CG31612	2L	21749882	21783038	-	4_group1	1130259	1166725	-	2	17941	18271	21764767	21765097	0	NA	331	18932	19817	886	3	1	19947	3	17888	1728
CG1794	2R	5123504	5198478	-	3	14091152	14178321	-	1	25366	25441	5173037	5173112	0	NA	76	31021	31094	74	14	6	3631	9	71	3484
CG1429	2R	5425308	5470621	-	3	10890518	10946185	+	1	18511	19561	5451060	5452110	0	NA	1051	24578	25554	977	12	2	11147	11	446	9650
CG17835	2R	6990372	7023090	+	3	4524640	4563632	+	1	20806	21346	7011177	7011717	0	NA	541	24642	25175	534	4	2	27659	4	18000	9118
CG30482	2R	9513179	9522197	-	3	11212128	11221793	+	1	2911	3106	9519091	9519286	0	NA	196	3416	3647	232	3	2	3966	3	1430	2340
CG9847	2R	16994753	17005508	-	3	15628575	15641255	-	1	8011	8506	16997002	16997497	1	CG30282	496	9806	10321	516	5	3	6769	5	5214	1059
CG13499	2R	17512487	17547140	-	3	15423434	15464842	-	1	14446	14836	17532304	17532694	0	NA	391	17609	17996	388	2	2	32110	2	12272	19447
CG6883	3L	350055	360848	-	XR_group3a	1065471	1077196	+	1	1276	1846	359002	359572	0	NA	571	2501	3050	550	9	1	2523	9	377	1575
CG6883	3L	350055	360848	-	XR_group3a	1065471	1077196	+	2	3826	4216	356632	357022	0	NA	391	5044	5483	440	9	2	2152	8	168	1593
CG17046	3L	417790	524121	-	XR_group3a	861380	1002250	+	1	29686	29731	494390	494435	0	NA	46	37900	37940	41	18	2	5913	14	3707	2160
CG17046	3L	417790	524121	-	XR_group3a	861380	1002250	+	2	68746	69316	454805	455375	0	NA	571	86952	87735	784	18	5	43328	18	34042	8715
CG1921	3L	3384669	3408467	-	XR_group8	5474681	5504585	-	1	9946	10006	3398461	3398521	0	NA	61	11026	11082	57	2	2	11882	2	1813	10008
CG10840	3L	3412186	3444134	-	XR_group8	5510036	5551805	-	1	6766	7021	3437113	3437368	0	NA	256	10613	10884	272	8	4	9490	7	3377	5857
CG10579	3L	3499217	3592083	+	XR_group8	5620619	5734169	+	1	16741	16891	3515957	3516107	0	NA	151	19494	19689	196	14	1	26753	14	15596	11006
CG32264	3L	3700729	3784820	-	XR_group9	122446	237067	-	1	71551	72196	3712624	3713269	0	NA	646	94346	95186	841	15	9	18123	14	12257	5220
CG32239	3L	4673645	4777101	+	XR_group8	2787732	2930610	+	1	23971	24991	4697615	4698635	0	NA	1021	34142	35174	1033	10	2	25221	10	9117	15083
CG32406	3L	5971161	6000157	+	XR_group9	3010466	3043831	-	1	18991	19036	5990151	5990196	0	NA	46	19786	19828	43	6	1	20406	6	18550	1810
CG33275	3L	7567053	7613528	+	XR_group6	1590594	1647808	+	1	4906	6136	7571958	7573188	0	NA	1231	6902	8219	1318	17	1	9342	16	4565	3546
CG4974	3L	8801453	8864116	+	XR_group8	8653914	8727698	-	1	37501	39121	8838953	8840573	0	NA	1621	32292	34065	1774	8	1	48654	8	36502	10531
CG32062	3L	10489952	10567368	+	XR_group9	2264802	2364944	+	1	4096	4441	10494047	10494392	0	NA	346	10341	10972	632	13	2	49822	13	1793	47683
CG32082	3L	11109996	11136988	+	XR_group9	3927149	3958512	-	1	11446	11926	11121441	11121921	0	NA	481	13795	14418	624	11	1	14584	11	11205	2898
CG32139	3L	14077642	14096583	-	XR_group6	4779959	4804349	-	1	4036	4816	14091767	14092547	0	NA	781	7660	8482	823	6	1	4939	5	3848	310
CG7867	3L	14156131	14198510	+	XR_group9	239936	287258	+	1	25246	25531	14181376	14181661	0	NA	286	27454	27815	362	12	7	15648	12	2913	12449
CG17697	3L	14239606	14333907	+	XR_group9	312394	415414	+	1	3346	3901	14242951	14243506	0	NA	556	10180	10647	468	5	1	29170	4	1965	26649
CG17697	3L	14239606	14333907	+	XR_group9	312394	415414	+	2	35761	36391	14275366	14275996	0	NA	631	43476	43811	336	5	2	6844	2	5090	1123
CG17697	3L	14239606	14333907	+	XR_group9	312394	415414	+	3	52741	53041	14292346	14292646	0	NA	301	55196	55505	310	5	4	14636	3	9749	4586
CG13475	3L	14548474	14564827	-	XR_group9	629173	646509	-	1	4966	5641	14559186	14559861	0	NA	676	4834	5602	769	3	2	5692	2	1286	3730
CG32180	3L	17525417	17584566	-	XR_group6	2214316	2283625	-	1	48976	49021	17535545	17535590	0	NA	46	55270	55315	46	8	6	9067	6	4460	4561
CG7383	3L	21742544	21751822	+	XR_group6	4388947	4398029	-	1	2956	3196	21745499	21745739	0	NA	241	5367	5621	255	3	2	5541	3	2420	2880
CG7437	3L	21813470	21860542	+	XR_group6	5171924	5230600	-	1	20896	21571	21834365	21835040	0	NA	676	22945	23698	754	8	1	27404	8	20582	6146
CG1133	3R	678567	695709	+	2	22040135	22061162	-	1	2761	3556	681327	682122	0	NA	796	2538	3404	867	2	1	14088	2	1550	11742
CG1133	3R	678567	695709	+	2	22040135	22061162	-	2	9376	9556	687942	688122	0	NA	181	11164	11416	253	2	1	14088	2	8165	5742
CG31481	3R	2533518	2567785	-	2	19752175	19792397	+	1	13741	14311	2553474	2554044	0	NA	571	15808	16350	543	8	2	12317	7	11226	520
CG7918	3R	3885006	3912767	+	2	6335528	6366715	-	1	17971	18871	3902976	3903876	0	NA	901	21184	21765	582	3	1	22663	3	17726	4036
CG33208	3R	5828033	5868543	-	2	5049414	5101104	+	1	9931	10396	5858147	5858612	0	NA	466	9902	11066	1165	26	3	10434	26	4924	5044
CG9924	3R	9793674	9857777	-	2	13482154	13561620	+	1	29056	30076	9827701	9828721	0	NA	1021	37569	38187	619	11	4	51847	11	20645	30181
CG6963	3R	12098176	12128095	+	2	22427730	22466212	-	1	4501	7036	12102676	12105211	0	NA	2536	7506	10575	3070	17	3	5738	16	1784	1418
CG14880	3R	12186051	12194026	-	2	22357492	22365721	+	1	5326	5521	12188505	12188700	0	NA	196	4850	5072	223	4	2	3071	4	2537	338
CG6993	3R	12200150	12229405	-	2	22313655	22352537	+	1	3286	3361	12226044	12226119	0	NA	76	5718	5792	75	7	2	10935	7	1441	9418
CG6993	3R	12200150	12229405	-	2	22313655	22352537	+	2	7651	8671	12220734	12221754	0	NA	1021	12227	13119	893	7	2	10935	7	5806	4108
CG31175	3R	15289255	15421117	+	2	29676222	29870665	+	1	5386	6496	15294640	15295750	0	NA	1111	12671	14830	2160	35	2	12276	33	4071	7094
CG31175	3R	15289255	15421117	+	2	29676222	29870665	+	2	83221	83686	15372475	15372940	0	NA	466	118202	118719	518	35	23	47738	35	39673	7599
CG4451	3R	15755436	15834244	-	2	27746829	27864708	+	1	11446	13966	15820278	15822798	0	NA	2521	22513	26920	4408	5	2	67778	5	9157	56100
CG6376	3R	17446026	17486127	-	2	23792914	23843054	-	1	25141	25516	17460611	17460986	0	NA	376	30669	31365	697	8	3	4730	5	2487	1867
CG31176	3R	17498018	17545380	-	2	23852279	23917794	-	1	36871	38116	17507264	17508509	0	NA	1246	50610	51915	1306	2	1	44598	2	35530	7822
CG18389	3R	17801348	17837910	+	2	6620126	6657437	+	1	8221	8866	17809568	17810213	0	NA	646	9348	9996	649	4	1	19465	4	7791	11028
CG31163	3R	17959580	18123793	+	2	12070739	12239852	+	1	73456	74431	18033035	18034010	0	NA	976	98268	99188	921	20	4	103220	20	32585	69659
CG17077	3R	19116826	19171884	-	2	9418604	9498629	+	1	2071	2506	19169378	19169813	0	NA	436	6350	6741	392	10	1	4870	8	1305	3129
CG5405	3R	19824159	19857532	-	2	14285112	14325961	-	1	4471	7681	19849851	19853061	0	NA	3211	5804	8710	2907	11	2	16865	11	3153	10501
CG33100	3R	19889511	19934671	-	2	14356536	14414426	-	1	16876	17686	19916985	19917795	0	NA	811	20758	21982	1225	3	2	42494	3	14750	26933
CG15552	3R	26891079	26909129	+	2	233085	249083	-	1	8701	8746	26899779	26899824	0	NA	46	12829	12873	45	2	2	8529	2	694	7789