#NEXUS [time-calibrated tree from BEAST for 1 rate all fossil calibrations analyses, Fig 7A] [Begin taxa; Dimensions ntax=13; Taxlabels Basiliscus_basiliscus Callisaurus_draconoides Chamaeleo_calyptratus Cophosaurus_texanus Holbrookia_maculata Leiolepis_belliana Phrynosoma_platyrhinos Uma_exsul Uma_inornata Uma_notata Uma_paraphygas Uma_scoparia Urosaurus_ornatus ; End; Begin trees; Translate 1 Basiliscus_basiliscus, 2 Callisaurus_draconoides, 3 Chamaeleo_calyptratus, 4 Cophosaurus_texanus, 5 Holbrookia_maculata, 6 Leiolepis_belliana, 7 Phrynosoma_platyrhinos, 8 Uma_exsul, 9 Uma_inornata, 10 Uma_notata, 11 Uma_paraphygas, 12 Uma_scoparia, 13 Urosaurus_ornatus ; tree TREE1 = [&R] 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End;] [###########################] #NEXUS [time-calibrated tree from BEAST for 2 rate all fossil calibrations analyses, Fig 7B] [Begin taxa; Dimensions ntax=13; Taxlabels Basiliscus_basiliscus Callisaurus_draconoides Chamaeleo_calyptratus Cophosaurus_texanus Holbrookia_maculata Leiolepis_belliana Phrynosoma_platyrhinos Uma_exsul Uma_inornata Uma_notata Uma_paraphygas Uma_scoparia Urosaurus_ornatus ; End; Begin trees; Translate 1 Basiliscus_basiliscus, 2 Callisaurus_draconoides, 3 Chamaeleo_calyptratus, 4 Cophosaurus_texanus, 5 Holbrookia_maculata, 6 Leiolepis_belliana, 7 Phrynosoma_platyrhinos, 8 Uma_exsul, 9 Uma_inornata, 10 Uma_notata, 11 Uma_paraphygas, 12 Uma_scoparia, 13 Urosaurus_ornatus ; tree TREE1 = [&R] ((1[&length_range={55.930936568278305,104.89583169014153},mitochondrial.rate_range={0.0017376224120247055,0.008997044574515774},length_95%_HPD={56.279842352520554,77.4946069458949},length=64.27529618521795,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.003329831783489937,0.006668555983392654},height_median=0.0,height_range={0.0,8.526512829121202E-14},nuclear.rate_median=6.438165360279402E-4,nuclear.rate_95%_HPD={5.069416168884312E-4,7.454950228054593E-4},nuclear.rate=6.357253956387714E-4,nuclear.rate_range={3.448956650371836E-4,8.351180721248294E-4},height_95%_HPD={0.0,2.8421709430404007E-14},mitochondrial.rate=0.005011486613139822,length_median=62.43205666725226,mitochondrial.rate_median=0.005000990861008012,height=1.4223289213077805E-14]:62.432056667252276,(((((11[&length_range={1.841665825853521,18.929982675474307},mitochondrial.rate_range={0.0023591910577706867,0.02837424385159703},length_95%_HPD={3.8013302183272915,10.160575830796907},length=6.840215510332227,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.0038056342209077157,0.010832749919538956},height_median=0.0,height_range={0.0,5.6843418860808015E-14},nuclear.rate_median=6.33869486952773E-4,nuclear.rate_95%_HPD={2.2594451374517564E-4,0.0012356570275468288},nuclear.rate=6.822764606920639E-4,nuclear.rate_range={4.654574098442625E-5,0.00789228910271732},height_95%_HPD={0.0,2.8421709430404007E-14},mitochondrial.rate=0.007057311669499579,length_median=6.710211242477104,mitochondrial.rate_median=0.006769528336030705,height=1.4295009620468592E-14]:6.710211242477101,8[&length_range={1.841665825853521,18.929982675474307},mitochondrial.rate_range={0.0018753638390884234,0.029413754329728575},length_95%_HPD={3.8013302183272915,10.160575830796907},length=6.840215510332227,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.0038641954993030134,0.010995830119613319},height_median=0.0,height_range={0.0,5.6843418860808015E-14},nuclear.rate_median=6.327875054444363E-4,nuclear.rate_95%_HPD={2.0089024548390708E-4,0.001218649042843049},nuclear.rate=6.797924964378823E-4,nuclear.rate_range={4.898921521516171E-5,0.009625987834422685},height_95%_HPD={0.0,2.8421709430404007E-14},mitochondrial.rate=0.007116283745917761,length_median=6.710211242477104,mitochondrial.rate_median=0.006819834886460954,height=1.4295009620468592E-14]:6.710211242477101)[&length_range={0.7758937116210767,21.648133080647614},mitochondrial.rate_range={0.0028221208605965224,0.07912069973996061},length_95%_HPD={4.544905321636337,13.04530615401264},length=8.709841059849753,posterior=1.0,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.004327329043359179,0.012620875543949495},height_median=6.710211242477101,height_range={1.8416658258535108,18.92998267547432},nuclear.rate_median=6.322910638952941E-4,nuclear.rate_95%_HPD={2.2011160282696605E-4,0.0012166410012475653},nuclear.rate=6.780604376400391E-4,nuclear.rate_range={3.298752885516913E-5,0.0069096829634105305},height_95%_HPD={3.8013302183273083,10.160575830796915},mitochondrial.rate=0.008067578361900913,length_median=8.595329339490888,mitochondrial.rate_median=0.007609406050570628,height=6.840215510332242]:8.750984459633528,(12[&length_range={2.073999590760731,15.052305180486922},mitochondrial.rate_range={0.0020370059578359986,0.019771176995476893},length_95%_HPD={2.857173425783676,7.115400970409858},length=4.849531421924135,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.004250100517418037,0.011475147100639906},height_median=0.0,height_range={0.0,8.526512829121202E-14},nuclear.rate_median=6.117319463521392E-4,nuclear.rate_95%_HPD={3.540203015963519E-4,9.144384113609696E-4},nuclear.rate=6.235334668216457E-4,nuclear.rate_range={1.6320954668299725E-4,0.0015241489579642985},height_95%_HPD={0.0,2.8421709430404007E-14},mitochondrial.rate=0.007598726826334383,length_median=4.695052648871542,mitochondrial.rate_median=0.007348660613625828,height=1.4237055978583156E-14]:4.695052648871538,(10[&length_range={0.16063370819382186,3.2641329444497447},mitochondrial.rate_range={0.001773348084473465,0.0522421580683027},length_95%_HPD={0.4290164406133242,1.317376625445732},length=0.8494672561246346,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.00416707334658078,0.01377618890086033},height_median=0.0,height_range={0.0,8.526512829121202E-14},nuclear.rate_median=5.311795295161706E-4,nuclear.rate_95%_HPD={2.183942825149497E-4,8.741810118527797E-4},nuclear.rate=5.431459299671944E-4,nuclear.rate_range={6.314702706417238E-5,0.002111328433628252},height_95%_HPD={0.0,2.8421709430404007E-14},mitochondrial.rate=0.008400009295714545,length_median=0.8233300715849015,mitochondrial.rate_median=0.007920609598834952,height=1.4291678951394716E-14]:0.8233300715849197,9[&length_range={0.16063370819382186,3.2641329444497447},mitochondrial.rate_range={0.001165330074945243,0.026836708442592762},length_95%_HPD={0.4290164406133242,1.317376625445732},length=0.8494672561246346,mitochondrial.rate_95%_HPD={0.0026751377557090003,0.009104361134553225},height_median=0.0,height_range={0.0,8.526512829121202E-14},nuclear.rate_median=6.265767689530912E-4,nuclear.rate_95%_HPD={2.627740866373261E-4,0.00109740579898023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Leiolepis_belliana 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Phrynosoma_platyrhinos 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Callisaurus_draconoides 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Holbrookia_maculata 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