aalb_lnc	aara_ortholog	alignScore.x	exonID.x	locusID.x	indelRate.exon..x	amin_ortholog	alignScore.y	exonID.y	locusID.y	indelRate.exon..y
MSTRG.10956.1	MSTRG.628.1	69292	0.57	0.57	0.077	MSTRG.7133.1	64912	0.58	0.58	0.079
MSTRG.11065.1	MSTRG.995.1	12373	0.39	0.4	0.084	MSTRG.6366.1	242140	0.59	0.6	0.076
MSTRG.11867.1	MSTRG.7339.1	40968	0.07	0.35	0.073	MSTRG.7106.1	45287	0.1	0.39	0.081
MSTRG.12511.1	MSTRG.1429.1	102916	0.57	0.57	0.066	MSTRG.6102.1	510964	0.56	0.56	0.067
MSTRG.12576.1	MSTRG.1187.1	240313	0.11	0.11	0.071	MSTRG.6182.1	259858	0.12	0.12	0.077
MSTRG.12584.1	MSTRG.1392.1	274331	0.38	0.38	0.078	MSTRG.6136.1	338848	0.69	0.69	0.032
MSTRG.12595.1	MSTRG.1388.1	394966	0.63	0.63	0.082	MSTRG.6134.1	411302	0.59	0.6	0.072
MSTRG.12596.1	MSTRG.1388.1	409224	0.36	0.46	0.071	MSTRG.6134.1	419567	0.54	0.54	0.068
MSTRG.12647.1	MSTRG.942.1	32576	0.59	0.17	0.067	MSTRG.6452.1	53461	0.6	0.18	0.053
MSTRG.12647.2	MSTRG.942.1	33124	0.48	0.2	0.085	MSTRG.6452.1	53461	0.52	0.22	0.071
MSTRG.12945.1	MSTRG.7157.1	13494	0.09	0.09	0	MSTRG.13219.1	14986	0.28	0.28	0.066
MSTRG.1399.1	MSTRG.5386.1	24015	0.46	0.47	0.086	MSTRG.15540.1	267227	0.54	0.55	0.099
MSTRG.1400.1	MSTRG.5386.1	75013	0.52	0.52	0.084	MSTRG.15532.1	318259	0.58	0.58	0.076
MSTRG.14017.1	MSTRG.2881.1	120053	0.58	0.58	0.069	MSTRG.11180.1	305347	0.57	0.57	0.071
MSTRG.14433.1	MSTRG.5906.1	308983	0.33	0.3	0.076	MSTRG.11297.4	165157	0.52	0.4	0.079
MSTRG.1466.1	MSTRG.7485.1	24320	0.65	0.65	0.076	MSTRG.15176.1	158311	0.66	0.67	0.076
MSTRG.14729.1	MSTRG.2612.1	194901	0.38	0.38	0.069	MSTRG.11343.1	108882	0.33	0.33	0.075
MSTRG.14895.1	MSTRG.2956.1	135588	0.3	0.34	0.063	MSTRG.2987.1	105751	0.43	0.45	0.062
MSTRG.15245.1	MSTRG.16205.1	38377	0.11	0.46	0.031	MSTRG.11638.1	342663	0.08	0.08	0.068
MSTRG.15735.1	MSTRG.4924.1	36674	0.03	0.1	0.069	MSTRG.3022.1	495583	0.63	0.63	0.078
MSTRG.15861.1	MSTRG.5713.1	60261	0.62	0.63	0.084	MSTRG.5318.1	26897	0.09	0.52	0.03
MSTRG.16393.1	MSTRG.16271.1	19080	0.62	0.62	0.07	MSTRG.5051.1	355509	0.59	0.59	0.07
MSTRG.16512.1	MSTRG.5599.1	518154	0.53	0.53	0.08	MSTRG.4972.1	485944	0.37	0.37	0.076
MSTRG.16691.1	MSTRG.14818.1	489251	0.61	0.61	0.076	MSTRG.10911.1	508109	0.58	0.58	0.09
MSTRG.16700.14	MSTRG.14806.2	46267	0.45	0.58	0.049	MSTRG.10924.5	26577	0.3	0.57	0.058
MSTRG.1678.1	MSTRG.11900.1	16446	0.61	0.62	0.096	MSTRG.4429.1	17849	0.56	0.56	0.067
MSTRG.16833.1	MSTRG.8706.1	212254	0.25	0.25	0.075	MSTRG.4868.1	309391	0.03	0.05	0.092
MSTRG.17013.1	MSTRG.10588.1	174547	0.31	0.31	0.072	MSTRG.8732.1	176390	0.51	0.51	0.057
MSTRG.184.1	MSTRG.15269.1	310299	0.35	0.36	0.076	MSTRG.5418.1	343206	0.6	0.6	0.077
MSTRG.2003.1	MSTRG.15511.1	225199	0.16	0.07	0.085	MSTRG.5669.1	173831	0.55	0.58	0.083
MSTRG.2003.3	MSTRG.15511.1	53618	0.1	0.1	0.082	MSTRG.5669.1	173686	0.59	0.59	0.084
MSTRG.2003.4	MSTRG.15511.1	53618	0.11	0.1	0.082	MSTRG.5669.1	173686	0.59	0.59	0.085
MSTRG.2034.1	MSTRG.12872.1	292986	0.59	0.59	0.075	MSTRG.15386.1	292639	0.57	0.57	0.074
MSTRG.2426.1	MSTRG.11883.1	116050	0.1	0.1	0.081	MSTRG.14879.1	416283	0.01	0.63	0.106
MSTRG.2435.1	MSTRG.15775.1	19275	0.54	0.54	0.075	MSTRG.14893.1	181715	0.51	0.51	0.079
MSTRG.2437.3	MSTRG.15775.1	14383	0.31	0.08	0.082	MSTRG.14893.1	183194	0.66	0.17	0.057
MSTRG.2671.1	MSTRG.3338.1	61359	0.66	0.66	0.056	MSTRG.14476.1	383678	0.67	0.67	0.066
MSTRG.2672.1	MSTRG.3316.1	14651	0.49	0.46	0.087	MSTRG.14440.1	21132	0.15	0.22	0.083
MSTRG.3138.1	MSTRG.7429.1	127300	0.36	0.36	0.075	MSTRG.15132.1	369039	0.14	0.14	0.047
MSTRG.3240.1	MSTRG.7491.1	67916	0.64	0.64	0.067	MSTRG.15170.1	76603	0.65	0.65	0.067
MSTRG.3242.1	MSTRG.7492.1	67916	0.15	0.43	0.081	MSTRG.15171.1	69244	0.09	0.26	0.076
MSTRG.3277.1	MSTRG.7977.1	45034	0.49	0.49	0.078	MSTRG.15754.1	20891	0.44	0.44	0.089
MSTRG.3351.1	MSTRG.8902.1	121658	0.57	0.57	0.064	MSTRG.15792.1	155281	0.55	0.56	0.059
MSTRG.3542.1	MSTRG.3230.1	310043	0.56	0.56	0.068	MSTRG.14316.1	50267	0.63	0.63	0.076
MSTRG.3703.1	MSTRG.3508.1	432780	0.56	0.56	0.055	MSTRG.14789.1	316306	0.57	0.57	0.058
MSTRG.3745.2	MSTRG.3471.1	354424	0.12	0.05	0	MSTRG.8031.1	183662	0.09	0.1	0.075
MSTRG.3783.1	MSTRG.3564.1	362235	0.65	0.65	0.052	MSTRG.8091.1	15767	0.44	0.44	0.06
MSTRG.3831.1	MSTRG.8806.1	559794	0.68	0.68	0.062	MSTRG.15890.1	842469	0.61	0.61	0.064
MSTRG.3909.1	MSTRG.10204.1	65970	0.67	0.67	0.07	MSTRG.14146.1	77107	0.56	0.56	0.07
MSTRG.4337.12	MSTRG.12106.1	50597	0.07	0.04	0.075	MSTRG.127.3	16598	0.05	0.12	0.088
MSTRG.4342.1	MSTRG.12091.1	21884	0.58	0.59	0.087	MSTRG.126.1	18601	0.57	0.57	0.085
MSTRG.4596.1	MSTRG.12153.1	19073	0.5	0.5	0.099	MSTRG.77.1	401307	0.64	0.64	0.045
MSTRG.5322.1	MSTRG.16832.1	22022	0.46	0.44	0.083	MSTRG.9542.1	32850	0.57	0.57	0.081
MSTRG.5601.1	MSTRG.1827.1	457842	0.53	0.53	0.074	MSTRG.10074.1	449225	0.6	0.6	0.078
MSTRG.5604.1	MSTRG.1831.1	64285	0.36	0.36	0.083	MSTRG.10090.1	109517	0.59	0.6	0.088
MSTRG.5906.1	MSTRG.6964.1	178580	0.1	0.1	0.092	MSTRG.2108.1	589079	0.13	0.2	0.069
MSTRG.5998.1	MSTRG.12311.1	546611	0.73	0.73	0.034	MSTRG.9774.1	546907	0.7	0.7	0.024
MSTRG.7511.1	MSTRG.16421.1	55128	0.54	0.55	0.044	MSTRG.10085.1	35396	0.25	0.38	0.016
MSTRG.7909.1	MSTRG.12649.1	6077	0.33	0.33	0.084	MSTRG.1754.1	121492	0.55	0.55	0.068
MSTRG.7920.1	MSTRG.12649.1	200106	0.66	0.66	0.07	MSTRG.1744.1	215515	0.66	0.66	0.072
MSTRG.801.1	MSTRG.10057.1	60288	0.17	0.39	0.061	MSTRG.14010.1	15267	0.1	0.2	0.095
MSTRG.801.3	MSTRG.10057.1	60288	0.23	0.39	0.061	MSTRG.14010.1	15267	0.09	0.2	0.094
MSTRG.801.4	MSTRG.10057.1	70021	0.24	0.4	0.069	MSTRG.14010.1	32012	0.1	0.35	0.095
MSTRG.810.1	MSTRG.10066.1	68764	0.56	0.56	0.084	MSTRG.15553.1	109061	0.5	0.51	0.078
MSTRG.8189.1	MSTRG.6178.3	154455	0.43	0.24	0.047	MSTRG.2372.1	458077	0.38	0.21	0.048
MSTRG.8343.1	MSTRG.11296.1	20411	0.36	0.36	0.078	MSTRG.3500.1	178011	0.56	0.56	0.068
MSTRG.8347.1	MSTRG.11300.1	109517	0.54	0.54	0.073	MSTRG.3503.1	114248	0.55	0.55	0.075
MSTRG.8979.1	MSTRG.3850.1	215497	0.15	0.15	0.086	MSTRG.593.1	217186	0.56	0.56	0.043
MSTRG.9571.1	MSTRG.4694.1	67336	0.08	0.08	0.07	MSTRG.561.1	91575	0.64	0.64	0.077