MOTIFS IN SEQUENCES

Motifs conserved to (and beyond) MOUSE (depth:6)


NAVIGATE ▼
▶HUMAN (depth:1)▶PIG (depth:2)▶COW (depth:3)▶DOG (depth:4)▶RABBIT (depth:5)▶MOUSE (depth:6)




Coloured by Conservation >>

>HUMAN (19280 bases)

 CCTTCAGTTCTTAAAGCGCTGCAATTCGCTGCTGCAGCCATATTTCTTACTCTCTCGGGGCTGGAAGCTTCCTGACTGAAGATCTCTCTGCACTTGGGGTTCTTTCTAGAACATTTTCTA 120
 GTCCCCCAACACCCTTTATGGCGTATTTCTTTAAAAAAATCACCTAAATTCCATAAAATATTTTTTTAAATTCTATACTTTCTCCTAGTGTCTTCTTGACACGTCCTCCATATTTTTTTA 240
 AAGAAAGTATTTGGAATATTTTGAGGCAATTTTTAATATTTAAGGAATTTTTCTTTGGAATCATTTTTGGTTGACATCTCTGTTTTTTGTGGATCAGTTTTTTACTCTTCCACTCTCTTT 360
 TCTATATTTTGCCCATCGGGGCTGCGGATACCTGGTTTTATTATTTTTTCTTTGCCCAACGGGGCCGTGGATACCTGCCTTTTAATTCTTTTTTATTCGCCCATCGGGGCCGCGGATACC 480
 TGCTTTTTATTTTTTTTTCCTTAGCCCATCGGGGTATCGGATACCTGCTGATTCCCTTCCCCTCTGAACCCCCAACACTCTGGCCCATCGGGGTGACGGATATCTGCTTTTTAAAAATTT 600
 TCTTTTTTTGGCCCATCGGGGCTTCGGATACCTGCTTTTTTTTTTTTTATTTTTCCTTGCCCATCGGGGCCTCGGATACCTGCTTTAATTTTTGTTTTTCTGGCCCATCGGGGCCGCGGA 720
 TACCTGCTTTGATTTTTTTTTTTCATCGCCCATCGGTGCTTTTTATGGATGAAAAAATGTTGGTTTTGTGGGTTGTTGCACTCTCTGGAATATCTACACTTTTTTTTGCTGCTGATCATT 840
 TGGTGGTGTGTGAGTGTACCTACCGCTTTGGCAGAGAATGACTCTGCAGTTAAGCTAAGGGCGTGTTCAGATTGTGGAGGAAAAGTGGCCGCCATTTTAGACTTGCCGCATAACTCGGCT 960
 TAGGGCTAGTCGTTTGTGCTAAGTTAAACTAGGGAGGCAAGATGGATGATAGCAGGTCAGGCAGAGGAAGTCATGTGCATTGCATGAGCTAAACCTATCTGAATGAATTGATTTGGGGCT 1080
 TGTTAGGAGCTTTGCGTGATTGTTGTATCGGGAGGCAGTAAGAATCATCTTTTATCAGTACAAGGGACTAGTTAAAAATGGAAGGTTAGGAAAGACTAAGGTGCAGGGCTTAAAATGGCG 1200
 ATTTTGACATTGCGGCATTGCTCAGCATGGCGGGCTGTGCTTTGTTAGGTTGTCCAAAATGGCGGATCCAGTTCTGTCGCAGTGTTCAAGTGGCGGGAAGGCCACATCATGATGGGCGAG 1320
 GCTTTGTTAAGTGGTTAGCATGGTGGTGGACATGTGCGGTCACACAGGAAAAGATGGCGGCTGAAGGTCTTGCCGCAGTGTAAAACATGGCGGGCCTCTTTGTCTTTGCTGTGTGCTTTT 1440
 CGTGTTGGGTTTTGCCGCAGGGACAATATGGCAGGCGTTGTCATATGTATATCATGGCTTTTGTCACGTGGACATCATGGCGGGCTTGCCGCATTGTTAAAGATGGCGGGTTTTGCCGCC 1560
 TAGTGCCACGCAGAGCGGGAGAAAAGGTGGGATGGACAGTGCTGGATTGCTGCATAACCCAACCAATTAGAAATGGGGGTGGAATTGATCACAGCCAATTAGAGCAGAAGATGGAATTAG 1680
 ACTGATGACACACTGTCCAGCTACTCAGCGAAGACCTGGGTGAATTAGCATGGCACTTCGCAGCTGTCTTTAGCCAGTCAGGAGAAAGAAGTGGAGGGGCCACGTGTATGTCTCCCAGTG 1800
 GGCGGTACACCAGGTGTTTTCAAGGTCTTTTCAAGGACATTTAGCCTTTCCACCTCTGTCCCCTCTTATTTGTCCCCTCCTGTCCAGTGCTGCCTCTTGCAGTGCTGGATATCTGGCTGT 1920
 GTGGTCTGAACCTCCCTCCATTCCTCTGTATTGGTGCCTCACCTAAGGCTAAGTATACCTCCCCCCCCACCCCCCAACCCCCCCAACTCCCCACCCCCACCCCCCACCCCCCACCTCCCC 2040
 ACCCCCCTACCCCCCTACCCCCCTACCCCCCTCTGGTCTGCCCTGCACTGCACTGTTGCCATGGGCAGTGCTCCAGGCCTGCTTGGTGTGGACATGGTGGTGAGCCGTGGCAAGGACCAG 2160
 AATGGATCACAGATGATCGTTGGCCAACAGGTGGCAGAAGAGGAATTCCTGCCTTCCTCAAGAGGAACACCTACCCCTTGGCTAATGCTGGGGTCGGATTTTGATTTATATTTATCTTTT 2280
 GGATGTCAGTCATACAGTCTGATTTTGTGGTTTGCTAGTGTTTGAATTTAAGTCTTAAGTGACTATTATAGAAATGTATTAAGAGGCTTTATTTGTAGAATTCACTTTAATTACATTTAA 2400
 TGAGTTTTTGTTTTGAGTTCCTTAAAATTCCTTAAAGTTTTTAGCTTCTCATTACAAATTCCTTAACCTTTTTTTGGCAGTAGATAGTCAAAGTCAAATCATTTCTAATGTTTTAAAAAT 2520
 GTGCTGGTCATTTTCTTTGAAATTGACTTAACTATTTTCCTTTGAAGAGTCTGTAGCACAGAAACAGTAAAAAATTTAACTTCATGACCTAATGTAAAAAAGAGTGTTTGAAGGTTTACA 2640
 CAGGTCCAGGCCTTGCTTTGTTCCCATCCTTGATGCTGCACTAATTGACTAATCACCTACTTATCAGACAGGAAACTTGAATTGCTGTGGTCTGGTGTCCTCTATTCAGACTTATTATAT 2760
 TGGAGTATTTCAATTTTTCGTTGTATCCTGCCTGCCTAGCATCCAGTTCCTCCCCAGCCCTGCTCCCAGCAAACCCCTAGTCTAGCCCCAGCCCTACTCCCACCCCGCCCCAGCCCTGCC 2880
 CCAGCCCCAGTCCCCTAACCCCCCAGCCCTAGCCCCAGTCCCAGTCCTAGTTCCTCAGTCCCGCCCAGCTTCTCTCGAAAGTCACTCTAATTTTCATTGATTCAGTGCTCAAAATAAGTT 3000
 GTCCATTGCTTATCCTATTATACTGGGATATTCCGTTTACCCTTGGCATTGCTGATCTTCAGTACTGACTCCTTGACCATTTTCAGTTAATGCATACAATCCCATTTGTCTGTGATCTCA 3120
 GGACAAAGAATTTCCTTACTCGGTACGTTGAAGTTAGGGAATGTCAATTGAGAGCTTTCTATCAGAGCATTATTGCCCACAATTTGAGTTACTTATCATTTTCTCGATCCCCTGCCCTTA 3240
 AAGGAGAAACCATTTCTCTGTCATTGCTTCTGTAGTCACAGTCCCAATTTTGAGTAGTGATCTTTTCTTGTGTACTGTGTTGGCCACCTAAAACTCTTTGCATTGAGTAAAATTCTAATT 3360
 GCCAATAATCCTACCCATTGGATTAGACAGCACTCTGAACCCCATTTGCATTCAGCAGGGGGTCGCAGACAACCCGTCTTTTGTTGGACAGTTAAAATGCTCAGTCCCAATTGTCATAGC 3480
 TTTGCCTATTAAACAAAGGCACCCTACTGCGCTTTTTGCTGTGCTTCTGGAGAATCCTGCTGTTCTTGGACAATTAAAGAACAAAGTAGTAATTGCTAATTGTCTCACCCATTAATCATG 3600
 AAGACTACCAGTCGCCCTTGCATTTGCCTTGAGGCAGCGCTGACTACCTGAGATTTAAGAGTTTCTTAAATTATTGAGTAAAATCCCAATTATCCATAGTTCTGTTAGTTACACTATGGC 3720
 CTTTGCAAACATCTTTGCATAACAGCAGTGGGACTGACTCATTCTTAGAGCCCCTTCCCTTGGAATATTAATGGATACAATAGTAATTATTCATGGTTCTGCGTAACAGAGAAGACCCAC 3840
 TTATGTGTATGCCTTTATCATTGCTCCTAGATAGTGTGAACTACCTACCACCTTGCATTAATATGTAAAACACTAATTGCCCATAGTCCCACTCATTAGTCTAGGATGTCCTCTTTGCCA 3960
 TTGCTGCTGAGTTCTGACTACCCAAGTTTCCTTCTCTTAAACAGTTGATATGCATAATTGCATATATTCATGGTTCTGTGCAATAAAAATGGATTCTCACCCCATCCCACCTTCTGTGGG 4080
 ATGTTGCTAACGAGTGCAGATTATTCAATAACAGCTCTTGAACAGTTAATTTGCACAGTTGCAATTGTCCAGAGTCCTGTCCATTAGAAAGGGACTCTGTATCCTATTTGCACGCTACAA 4200
 TGTGGGCTGATCACCCAAGGACTCTTCTTGTGCATTGATGTTCATAATTGTATTTGTCCACGATCTTGTGCACTAACCCTTCCACTCCCTTTGTATTCCAGCAGGGGACCCTTACTACTC 4320
 AAGACCTCTGTACTAGGACAGTTTATGTGCACAATCCTAATTGATTAGAACTGAGTCTTTTATATCAAGGTCCCTGCATCATCTTTGCTTTACATCAAGAGGGTGCTGGTTACCTAATGC 4440
 CCCTCCTCCAGAAATTATTGATGTGCAAAATGCAATTTCCCTATCTGCTGTTAGTCTGGGGTCTCATCCCCTCATATTCCTTTTGTCTTACAGCAGGGGGTACTTGGGACTGTTAATGCG 4560
 CATAATTGCAATTATGGTCTTTTCCATTAAATTAAGATCCCAACTGCTCACACCCTCTTAGCATTACAGTAGAGGGTGCTAATCACAAGGACATTTCTTTTGTACTGTTAATGTGCTACT 4680
 TGCATTTGTCCCTCTTCCTGTGCACTAAAGACCCCACTCACTTCCCTAGTGTTCAGCAGTGGATGACCTCTAGTCAAGACCTTTGCACTAGGATAGTTAATGTGAACCATGGCAACTGAT 4800
 CACAACAATGTCTTTCAGATCAGATCCATTTTATCCTCCTTGTTTTACAGCAAGGGATATTAATTACCTATGTTACCTTTCCCTGGGACTATGAATGTGCAAAATTCCAATGTTCATGGT 4920
 CTCTCCCTTTAAACCTATATTCTACCCCTTTTACATTATAGAAAGGGATGCTGGAAACCCAGAGTCCTTCTCTTGGGACTCTTAATGTGTATTTCTAATTATCCATGACTCTT
AATGTGC
AATGTGCAT
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No matches to eCLIP DataMATCHES To TargetScan▶ miR-501-3p/502-3p:AUGCACC
 5040
 
AT
AATGTGCAT
Depth:6 (MOUSE)
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No matches to eCLIP DataMATCHES To TargetScan▶ miR-501-3p/502-3p:AUGCACC
ATTTTCAATTGCCTAATTGATTTCAATTGTCTAAGACATTTCAAATGTCTAATTGATTAGAACTGAGTCTTTTATATCAAGCTAATATCTAGCTTTTATATCAAGCTAATATCTTGAC 5160
 TTCTCAGCATCATAGAAGGGGGTACTGATTTCCTAAAGTCTTTCTTGAATTTCTATTATGCAAAATTGCCCTGAGGCCGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 5280
 CTGAGGTGGGAAGATCCCTTACTGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATTAAAAAAAAAAAAAAGTAAGACAATTGCCCTGGAATCCCATCCCCCTCACACCTCCTTGGCAAAGC 5400
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 CTGCAGGAGCTTCTAACTAGCCTGAATTCACTCTCTTGGACTGTTAATGTGCATACTTATATTTGCTGCTGTACTTTTTTACCATGTAAGGACCCCACCCACTGTATTTACATCCCAGCT 5640
 GGAAGTACCTACTACTTAAGACCCTTAGACTAGTAAAGTTAGCGTGCATAATCTTAGGTGTTATATACACATTTTCAGTTGCATACAGTTGTGCCTTTTATCAGGACTCCTGTACTTATC 5760
 AAAGCAGAGAGTGCTAATCAATATTAAGCCCTTCTCTTCGAACTGTAGATGGCATGTAATTGCAGTTGTCAATGGTCCTTCAATTAGACTTGGGTTTCTGACCTATCACACCCTCTTTGC 5880
 TTTATTGCATGGGGTACTATTCAC
TTAAGGCC
TTAAGGCC
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eCLIP MATCHES▶HNRNPL (bg=0.64%)No matches to TargetScan
CCTTTCTCAAACTGTTAATGTGCCTAATGACAATTACATCAGTATCCTTCCTTTTGAAGGACAGCATGGTTGGTGACACCTAAGGCCC 6000
 CATTTCTTGGCCTCCCAATATGTGTGATTGTATTTGTCGAGGTTGCTATGCACTAGAGAAGGAAAGTGCTCCCCTCATCCCCACTTTTCCCTTCCAGCAGGAAGTGCCCACCCCATAAGA 6120
 CCCTTTTATTTGGAGAGTCTAGGTGCACAATTGTAAGTGACCACAAGCATGCATCTTGGACATTTATGTGCGTAATCGCACACTGCTCATTCCATGTGAATAAGGTCCTACTCTCCGACC 6240
 CCTTTTGCAATACAGAAGGGTTGCTGATAACGCAGTCCCCTTTTCTTGGCATGTTGTGTGTGATTATAATCGTCTGGGATCCTATGCACTAGAAAAGGAGGGTCCTCTCCACATACCTCA 6360
 GTCTCACCTTTCCCTTCCAGCAGGGAGTGCCCACTCCATAAGACTCTCACATTTGGACAGTCAAGGTGCGTAATTGTTAAGTGAACACAACCATGCACCTTAGACATGGATTTGCATAAC 6480
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 CAGCAGGGAGTGCCCCCTCCATAAGATCATTACATTTGGACAATCAAGGTGCACAATTATAAGTGACCACAGCCATGCACCTTGGACATTATTGGACATTAATGTGCGTAACTGCACATG 7080
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 CTGTGTAATAGACATGAAAGCCTCCCCTGCCACACCCCACCTCCAATCTTCCTTTCCCTTCCACCAGGGAGTGTCCACTCCATATACCCTTACATTTGGACAATCAAGGTGCACAATTGT 7320
 AAGTGAGCATAGGCACTCACCTTGGACATGAATGTGCATAACTGCACATGGCCCATCCCATCTGAATAAGGTCCTACTCTCAGACCCTTTTTGCAGTACAGCAGGGGTGCTGATCACCAA 7440
 GGCCCCTTTTCCTGGCCTGTTATGTGTGTGATTATATTTGTTCCAGTTCCTGTGTAATAGACATGGAAGCCTCCCCTGCCACACTCCACCCCCAATCTTCCTTTCCCTTCTGGCAGGAAG 7560
 TACCCGCTCCATAAGACCCTTACATTTGGACAGTCAAGGTGCACAATTGTATGTGACCACAACCATGCACCTTGGACATAAATGTGTGTAACTGCACATGGCCCATCCCATCTGAATAAG 7680
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 CCTCCCCTGCCCCACCCCACCCTCAATCTTCCTTTCCCTTCTGGCAGGGAGTGCCAGCTCCATAAGAACCTTACATTTGGACAGTCAAGGTGCACAATTCTAAGTGACCGCAGCCATGCA 7920
 CCTTGGTCAATAATGTGTGTAACTGCACACGGCCTATCTCATCTGAATAAGGCCTTACTCTCAGACCCCTTTTGCAGTACAGCAGGGGTGCTGATAACCAAGGCCCATTTTCCTGGCCTG 8040
 TTATGTGTGTGATTATATTTGTCCAGGTTTCTGTGTACTAGACAAGGAAGCCTCCTCTGCCCCATCCCATCTACGCATAATCTTTCTTTTCCTCCCAGCAGGGAGTGCTCACTCCATAAG 8160
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 CCCCTTTGCAGTATAGCTGGGGTGCTGATCACTGAGGCCTCTTTGCTTGGCTTGTCTATATTCTTGTGTACTAGATAAGGGCACCTTCTCATGGACTCCCTTTGCTTTTCAACAAGGAGT 8400
 ACCCACTACTTTTTAAGATTCTTATATTTGTCCAAAGTACATGGTTTTAATTGACCACAACAATGTCCCTTGGACATTAATGTATGTAATCACCACATGGTTCATCCTAATTAAACAAAG 8520
 TTCTACCTTCTCACCCTCCATTTGCAGTATACCAGGGTTGCTGACCCCCTAAGTCCCCTTTTCTTGGCTTGTTGACATGCATAATTGCATTTATGTTGGTTCTTGTGCCCTAGACAAGGA 8640
 TGCCCCACCTCTTTTCAATAGTGGGTGCCCACTCCTTATGATCTTTACATTTGAACAGTTAATGTGAATAATTGCAGTTGTCCACAACCCTATCACTTCTAGGACCATTATACCTCTTTT 8760
 GCATTACTGTGGGGTATACTGTTTCCCTCCAAGGCCCCTTCTGGTGGACTATCAACATATAATTGAAATTTTCTTTTGTCTTTGTCAGTAGATTAAGGTCATACCCCATCACCTTTCCTT 8880
 TGTAGTACAACAGGGTGTCCTGATCAACCAAAGTCCTGTTGTTTTGGACTGTTAATATGTGCAATTACATTTGCTCCTGATCTGTGCACTAGATAAGGATCCTACCTACTTTCTTAGTGT 9000
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 CTTTTCTTTTAATATTAATGTCATAATTGTATTTGTGGACCTGTGTAGGAGAAAAAGACCCTATGTTCCTCCCATTACCCTTTGGATTGCTGCTGAGAAGTGTTAACTACTCATAATCTC 9360
 AGCTCTTGGACAATTAATAGCATTAATAACAATTATCAAGGGCACTGATCATTAGATAAGACTCCTGCTTCCTCGTTGCTTACATCGGGGGTACTGACCCACTAAGGCCCCTTGTACTGT 9480
 TAATGTGAATATTTGCAATTATATATGTCTCCTTCTGGTAGAGTGGGATATTATGCCCTAGTATCCCCTTTGCATTACTGCAGGGGCTGCTGACTACTCAAAACTTCTCCTGGGACTGTT 9600
 AATAG
GCACAATG
GCACAATG
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GCAGTTATCAATGGTTTTCTCCCTCCCTGACCTTGTTAAGCAAGCGCCCCACCCCACCCTTAGTTTCCCATGGCATAATAAAGTATAAGCATTGGAGTATTCCATGC 9720
 ACTTGTCTATCAAACAGTGGTCCATA
CTCCCA
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 TGACTATG
AAAAGCAG
AAAAGCAG
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 TGTGTTACTGCTTTACTGT
GCAAAAT
GCAAAAT
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 TGGCACTTTCTCTGCATTCTTCTTTCCAGAGCA
GATTGCCTGG
GATTGCCTGG
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 TGTCTCTCATTTTAACTGAGGGTGGTGGGTCTGTGGATAGAACACTGACTCTTGCTATTTTAATATCAAAGATATTCTAGAGTGGAACTCTTAAGACCAGTATCTTTGTGTGGGCTTTAC 10800
 CAGCATTCACTTTTAGAAAAACTACCTAAATTTTATAATCCTTTAATTTCTTCATCTGGAGCACCTGCCCCTACTTATTTCAAGAAGATTGCAGTAAAACGATTAAATGAGGGAACATAT 10920
 GCAGAGGTGCTTTTAAAAAGCATATGCCACCTTTTTTATTAATTATTATATAAAATGAAGCATTTAATTATAGTAATAATTTGAAGTAGTTTGAAGTACCACACTGAGGTGAGGACTTAA 11040
 AAATGATAAGACGAGTTCCCTATTTTATAAGAAAAATAAGCCAAAATTAAATATTCTTTTGGATATAAATTTCAACAGTGAGATAGCTGCCTAGTGGAAATGAATAATATCCCAGCCACT 11160
 AGTGTACAGGGTGTTTTGTGGCACAGGATTATGTAATATGGAACTGCTCAAGCAAATAACTAGTCATCACAACAGCAGTTCTTTGTAATAACTGAAAAAGAATATTGTTTCTCGGAGAAG 11280
 GATGTCA
AAAGATC
AAAGATC
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GGCCCAGCTCAGGGAGCAGTTTGCCCTACTAGCTCCTCGGACAGCTGTAAAGAAGAGTCTCTGGCTCTTTAGAATACT||GATCCCATTGAAGATACCACGCTGCA 11398
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 TCTGGCCAAGCTCCAGCTAATCTACTTGGATGGGTTGCCAGCTATCTGGAGAAAAAG||ATCTTCCTCAGAAGAATAGGCTTGTTGTTTTACAGTGTTAGTGATCCA
TTCCCTTTGA
TTCCCTTTGA
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CGA 11634
 TCCC
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TAGGTGGAGATGGGGCATGAGGATCCTCCAGGGGAA
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AAGCTCACTACCACTGG
GCAACA
GCAACA
Depth:6 (MOUSE)
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 GTCTCAAAAACAACCACCACACGTCAAG||CTCTTCATTGTTCCTATCTG
CCAAAT
CCAAAT
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GATCAACATGC
GATCAACATGC
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TGTGTAT
TGTGTAT
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TTCTCTTTG
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TTTCTAC
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ATTTCTC
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ATTTCTGCATTTCCTTTCTGCCTCTCTTGGGCTATTCTCTCTCTCCTCCCCTGCGTGCCTCAGCATCTCTTGCTGTTTGTGATTT 12470
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 TTGTGGAGCGGTTCCTTATGCCAGGCTGCCATGTGAGATGATCCAAGACCAAAACAAGGCCCTAGACTGCAGTAAAACCCAGAACTCAAGTAGGGCAGAAGGTGGAAGGCTCATATGGAT 12830
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>PIG (25215 bases)

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AAAAGGT
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>DOG (15827 bases)

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T
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AGGAGTACCCAGATATGCCAGCCTGTTGAGAAGCACCAGCCTGCAACACCTTTCTTCTTTGCTCTTGGGTGAGCGGGATTCTTGGGGTTTG 10440
 GGATTCCTAGTGATGGTTATAAAATTGGGCCTGGGACAGAGTAAGGCCCCAAGGAGACAGTTTGAACTCCCTGCTTATAGTAGTGGCCTAATAATTTGGGAGATTGTGCCAACACTGCTT 10560
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ATTGGCA
ATTGGCA
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TTGTGAAG
TTGTGAAG
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CATTATATA 10800
 AATCAGGAGTCATCATACCCTTTCCATAAAGGGTCAAATGGTAAATATTTTAAGTTTGTGGTCCAAATGGTCTCAGACATCTTTTTTTTTGTTTTACAACCCTTTAAAAAGGAAGAACTA 10920
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 CACTAAGGATACAATAATTATTGATGATCACACCTTGGTGACCTGAAGAAAAATATGTGAACGTGCTTTGTAAATTATAAAGCACTTAAAGGTTTATGAGTTTGATTTGATCAACAAATA 11160
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 TGTTTGATAAACGAATAACTCCTGTATTTGTGGCCATTGTGTTTCTGCTGCTCTGGTAATTTTAAGTAAAAATACAGTATTCCAGGTAGCAGAGAAACAAACACATGGAAACTGCTTTGA 11400
 AACCATAAGATACACTACAAACACAAGGGATTAAGCTATTGTGAGCACTTAAAATGTGCCAGATACATGCTAGGTGCTACAGATTGTCAAAGGGAGAAAGTGTTATTATGGAATTAAAAA 11520
 TTTCAGATCATGAAGGGCATATTAAAGTGTTTTAAACTAAAGCACTATATAAATACCAGTGGGTTATATGTTTATTAATCGATGAATATTATCTTTTACGGGCCAGGTACTGTTTGAGTA 11640
 CTGTGAAATCCAAGATAATGCTCCCATGTAATAAGAGGTAGGTTTATGTCCTAGACTAGTTAGATGTAAAGAATTAGATATTGTTTATTTTAATCAATCAAGGCTTTACTGGGCATATCT 11760
 AAATTATCACCAGTGTATTTTCCTAGGTGACAAGAAATTAGAATGATTGAGAATGCCCTTGCACTTTCTTTCTTTTTTTTTTTAAGATTTTATTTATTTATTCATGAGAGACCCAGAAAG 11880
 AGAGAAACAGAGACACAGGCAGAGGGAGAAGCAGGCTCCATGCAGGGAGCCTTATGTGGGACTCAATCCCAGGATTCCAGGATCACGCCCTGGGCTGAAGGCCGACACTAAACCGCTGAG 12000
 CCACCCAGGTGTCCCCACCCTTGCACTTTCTGGAGTGCTATATAAGTGTAAGATATTAGCTGTTTTCTGTGTGAATAAAACCTTTCTGTGAGATAGGCATTTTCTCTACAAAATTCTCAT 12120
 TTTGTGCTTGACATCCACTATGATGAAGGTAGTATGAATAGTTATACAAACTGAGGGTTTAGGTACTTGTTGAATTAATGAATATCCTCAGTTGCTTAATAGGTGAACTCATTATTACAG 12240
 GCACTATAGAGATACACAGACTTAATATTTCATTGTGCTTACAGTTGAAAATAAAACAATATATGTTAGTATTTTGGGAAGTCTACAGCACCGTGTAAGTTTAACTATTTTCTAATTCGG 12360
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 TATCTGATAAATGTAAAACTGGATAATAATTGTCTATTATGTGCCAATCTCCTTGCTAGGCATTGGGAATGTGAAGATAAACCATCTTTATTGTTTCCTGGGTAGCAGCAGATAATGTAT 12600
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 CTCATTATCAGAGATCTGTGTAAATTTATAAAGCCTCGTGTTCTATAAGGAAATAACTTGGCTTAATGAGTGATTACTGGTTACTTTCTTTAAAAGAGCTTATTTAATAAAAACATGGGA 12840
 AAAATGCCATTGTGCCAGGCAGAATGCTAAATGCTGAGCTCTGTGGAAAGATAAAATCTCAGAAATGTACTTGCTCCCAGGCCTGGCTGAAGAGATGGGAAATATTTTTAAGAAGCAGGG 12960
 TGTTACAATCCTCTATCAGTCTTTAAAATGTTCAATGCTGAAGGTGGAGGTGAATTATTTCCACCTTGGCCTGGCTTGAGTCATTAAAGGAGTAAAAATAAATCACTAAGGTTTGCTTTT 13080
 AGATTCATTTGATATATACATCATTTTTTATGTGGAATACATCATTCTAGATCCTAAGAGAATTGAAATGGGCCAAGTTAAGAGCGCATTAGAATAAAGATTATAGATGAAGATAAGAAA 13200
 ATATCATTGAGTTTTGAGTAAATATTTTAATGCTTATGTTCTGGAAGGTATTATGCTAGATAAATTCGTTGAATGGGTCTGGTCCAGAAAACCCATGGACTTGTCTTGGAGATTAAAAAA 13320
 ATAGAAAAATAAGGCACATGGTTCTTTTAAAATTAAATGAAGACATTACTCCTAGTTCTAGAGAGTCCCAATGTCACATGCTCATTGACCTAGTTTGAAGCCAGCAGACTGATAAAAGGG 13440
 CACCTAGGGCTTACCCTTGAATTAATTAATTTACTATTCTGTTTTTATTATAAATGAATGACTTAAGATGAGAATTGAGATAAAACAACTAGTTTTAAAACATTTGCATATTGGCCTGGC 13560
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 CTTGACCAAAATGTAATTTAATCTCATTAGCTTTTGGTGGAAACATAAGAATAAATTTAATAAGAGAATGCAGTTCTTTCATTAGTTGAAAAAACTTTTTTTTTTTAAAAAACTTTATTG 13800
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 CTACAGGGTTGAGTGCCTGTTATGTATAAGGTGTTTTGCTATATTCCCAGTTTGCCCCAGAGACAAGAAAAAAATGAATGCTTTCCTAGAGAACATTTAAACTTTCCTTTTGGTTTGTTT 14280
 TGTGGTAGGGACATGGCTCAGTGCTTAGTACCTTAATAATGTTGTGGTTTTTAATTCCTTTTCCATGTTTCTTTTAGTACTCTGGCCACTACAATAAGCAGGGTTTTCAATTGAGCTAGC 14400
 TTTTTAAGTATCAGGAACTTTCCTTATAGTAGACACTTTATTTTTACCGACCCATCCCTCAGGAAAAATGGCTGTTTTTGTATTAAATGTTGCCATTAAAATGGCTTTTTTTGTATTAAA 14520
 TATTAAAGCCACTGCTGGGCAGGAGGAGGGATGACAACTAATTCCCAATCCCCAGTCTCACTGGTAACAGCCTTGAGAAAGCACTCATACTCAGGCCACAATTGGTTTTGAAATGCATTT 14640
 ACCAGTTTTATCTGCTTTTAATTCTTTACATTTTACATACTGACAAATAAACACTGCCTAAATAGATCTCTTTGAAGAACGATCCTCAGATGGTACATAACATAATGGGAGAGACATGAT 14760
 TTCTCTTTTGCAACAGCTTTGCAACTTAACCTTTAGAAATCTCACCATCAAAACATGTTTCAGGAAAGGATTTCTTAGAGTGGAATTATGTCAGTGAATAAAAATAGCTTAACAATTTTA 14880
 CCATGTTTAATTTTTAAGAATAGAAATTGGAAATAATTGGCAAAAATTTGAGGTAAACAACAACAAAAAATTCTCAATCTAGGCCTAACTGGGTTTTGACCTTTTCTATTTTTAAATCAC 15000
 TCATAGAGGGTGGGATTAGGAGGAAGAGTGAAAG
AAAAGGT
AAAAGGT
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No matches to TargetScan
CAAACCAGTCTCTAAGGGCAGCCTGCTTGTGCTTTGGATTGGTTTTAAGAGCATTACTACTTCCAAATCTAACTAGGGG 15120
 ATTGCCTTTTTTCAGTTTAATGCAATTCCAATAACTAGTCATTGTTGAGATGAAGACACAGTACTTTCTCCCCACTCATTTCTATAAGTTTTTGAGAAACATTTTTGGGCTAAATGGTTA 15240
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>RABBIT (10466 bases)

 CAGCCCCAGCCCCAGCCCAGAGCTCCCCACTCCAAAACCCAGCCCTAACCTCAGTCTTAGCCACTCAGCCAAAGCTTGGCTGCTCCCTAGACCCACTCCAATTTTCATTTGTTGAGCACT 120
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 CTAGGACAGTTGATATGCGCAATTTTAATTTATTAGAATTGAGTCTTTTTAAAAGTCAAAATCCCTGCCACTTTCTTTGCTTTACATCAAGAGGGTGCTTGATTACCTGAGGCCCCTTGT 1560
 CTTGATATTGCTGATATCTCCTGTTATTCTGGGATCCCATCCCCTCAGGCTCCATTTGCATTGCCTTAGGGGATACTTGGGACTATA
AATGTGCAT
AATGTGCAT
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MATCHES To TargetScan▶ miR-501-3p/502-3p:AUGCACC
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TTAAGGCC
TTAAGGCC
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CCTTTATTAAACTGTTAATGTAGTTGCATAATGACAACTACATTAGGATTCTTCCCCTTCAAATTCCCAAAAAAAAGTACTATAGGAATG 2280
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 TGACATTAATGTATGTAATCATGACATTGTTCATCCTATTTGACCAAGATCCTATCCTCTTGCTCTCCATTTACAATGTACCAGGGATGCTGACCTCTAAGCTCCCTTTTCTTGGTTTGT 4560
 TAATGCACATAATATATTTGTCTGGGTTCTTGTGCATTAAACAAGGATAGCCCACCTCTGAGTTCCTATGCCTTTTAATAGGTGGTTTCCACTGACTCAGACCTTTGAATTTGGACAATT 4680
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 ACATGAACAGTTTGCTAAGTATGTCCTATACCAGAACTCCTGTAATCTCCCTGCTTTACAGCAGGGGGTGCTATGCACTCAGTGCCTTGTCTTTTGGATTTAATGTGCATTAATGCAATT 5160
 GCTCCTCTCTTAGGGTATCACTTCCTTATACTCCTTTTTTTTTGAATCAGGGGCATATTAACTATGTATTGGCCCCTTTTCCATGAATATTAATGTACATAATTGGTCTGTGGACCTATG 5280
 TGGTAGAAAAGAACCCTATGCTCCTACCACTGCCTTGTGATTGCAGCTGAGGAGAGCTAACCATAACCTCAGCTCTTGGGCAATTAATATGCAACAATAACACTTATTGAGAATACGGAT 5400
 TGTCAGATGGAAACCCTGTACCCTCTTCATTTGTAACAGGGGTGCTGACCAACTGTGACACCTTGAACTATTAACTTGAATATTTGCACTTGGGCTCCCCCTTTCTGTTAGACTGGAGTA 5520
 ATACACCCTTACATAACCTGTGCATTACTTCAGGGTGTGCTGGCCACTCCAAACTTCTCCTTGGACTGTTCATGG
GCACAATG
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CTCCCA
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 C
AAAAGCAG
AAAAGCAG
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GCCTGGAACTATGTGGATGAACCTTCATTTTTTTCCTGCAATTGCTAATTATTCTGATTTCAATTATTGTCACAATCTGGGTACAGGAGTCATTCCTTCCCAGCTCTATTA 6360
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GCAAAAT
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>MOUSE (17918 bases)

 CGGCTTGCTCCAGCCATGTTTGCTCGTTTCCCGTGGATGTGCGGTTCTTCCGTGGTTTCTCTCCATCTAAGGAGCTTTGGGGGAACATTTTTAGTTCCCCTACCACCAAGCCTTATGGCT 120
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AATGTGCAT
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TTAAGGCC
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GCACAATG
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CTCCCA
CTCCCA
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AT
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 9834
 
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